위생 기능을 활용하더라도, 관리가 소홀하면 오염이 쉽게 번식할 수 있습니다. 따라서 오염과 번식이 적은 소재로 만들어진 제품을 선택하거나, 직접 세척이 가능한 제품을 고려하는 것이 중요합니다.

[[▶ 분리 세척 정수기의 주된 오염 원인은 외부로 노출된 코크입니다. ]]
가정용 정수기의 위생 조사결과, 관리가 미흡한 경우 세균이 검출될 수 있습니다.
따라서 분리하여 세척이 가능한 제품을 선택하는 것이 좋습니다.

[[▶ 스테인리스 소재 정수기에는 주로 유연성이 좋은 플라스틱 소재가 사용됩니다.]]
그러나 오랜 사용으로 인해 물 때가 쌓이면 관이 변색될 수 있습니다. 
최근에는 물 때 오염을 줄이기 위해 스테인리스 소재로 대체되고 있습니다. 스테인리스는 물 때 오염을 줄이지만, 휘어지기 어려운 특성이 있어 PP(콜리프로필렌) 또는 폴리케톤과 혼합하여 사용됩니다.
정수기가 스테인리스가 아닌 경우에는 주기적으로 부품을 교체할 수 있는지 확인하는 것이 좋습니다.

[[[예시 - LG]]]
                        LG 정수기는 나노 필터를 사용하고 있습니다. 이 필터는 미생물, 세균, 중금속 등을 제거할 수 있는데, 교체 주기는 종류에 따라 다릅니다. 

                        ▶ 중금속 9 흡착 필터: 6개월마다 교체합니다. 
                        ▶ 바이러스 멀티 필터: 12개월마다 교체합니다. 

                        LG 정수기의 역삼투압 중공사막 나노 필터는 작은 부분까지 걸러서 순수한 정수를 제공합니다. 
                        이 필터는 미생물, 박테리아를 제거하고 미네랄을 유지하는데, 중공사막의 최상위 버전으로서 미생물, 박테리아, 중금속을 제거하는 능력을 갖추고 있습니다. 미네랄 성분까지 제거되기 때문에 가격은 비싸지만, 가성비가 우수합니다. 필터 교체 주기는 비교적 짧지만 밸런스가 우수하며, 중공사막 제품보다 가격이 높을 수 있습니다.

 
                        자가 관리를 원하는 경우, 필터를 46개월 주기로 배송받아 스스로 관리할 수 있습니다. 
                        이 방식은 방문 관리에 비해 15~30% 저렴하지만, 전문가에 비해 위생 관리가 미흡하고 자가 관리 제품의 종류가 제한적이라는 단점이 있습니다.